Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms