Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1aP61092 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1aP61092 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1aP61092 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1aP61092 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1aP61092 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah1aP61092 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siah1aP61092 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siah1aP61092 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms