Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PlnP61014 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PlnP61014 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PlnP61014 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms