Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms