Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gsc2P56916 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gsc2P56916 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms