Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5bP56480 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms