Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms