Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms