Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dbx1P52950 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Dbx1P52950 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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