Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms