Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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