Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms