Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms