Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ThpoP40226 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ThpoP40226 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ThpoP40226 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms