Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms