Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms