Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoc1P34928 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms