Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprmP28828 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprmP28828 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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