Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BgnP28653 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BgnP28653 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BgnP28653 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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