Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde6aP27664 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pde6aP27664 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6aP27664 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6aP27664 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6aP27664 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6aP27664 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6aP27664 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6aP27664 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6aP27664 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms