Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Xrcc5P27641 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xrcc5P27641 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms