Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfraP26618 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms