Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms