Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prim1P20664 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms