Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pou5f1P20263 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms