Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18530 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18530 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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P18530 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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