Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18529 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18529 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms