Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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