Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhoP15409 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RhoP15409 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhoP15409 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhoP15409 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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RhoP15409 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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