Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms