Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P10404 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P10404 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P10404 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P10404 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P10404 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P10404 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P10404 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P10404 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P10404 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P10404 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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