Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ccl2P10148 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ccl2P10148 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms