Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb7P09024 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms