Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms