Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MscO88940 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MscO88940 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MscO88940 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MscO88940 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MscO88940 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MscO88940 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MscO88940 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MscO88940 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MscO88940 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MscO88940 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MscO88940 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MscO88940 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MscO88940 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MscO88940 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms