Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cfdp1O88271 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms