Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms