Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Foxq1O70220 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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