Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Copb2O55029 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Copb2O55029 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Copb2O55029 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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