Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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BckdkO55028 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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BckdkO55028 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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BckdkO55028 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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BckdkO55028 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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BckdkO55028 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BckdkO55028 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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