Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh16O54909 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh16O54909 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh16O54909 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh16O54909 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh16O54909 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rdh16O54909 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rdh16O54909 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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