Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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