Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc27a2O35488 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc27a2O35488 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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