Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atf6bO35451 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atf6bO35451 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atf6bO35451 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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