Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Prrt1O35449 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Prrt1O35449 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Prrt1O35449 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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