Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ColqO35348 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ColqO35348 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ColqO35348 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ColqO35348 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ColqO35348 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ColqO35348 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ColqO35348 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ColqO35348 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms