Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms