Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H2-M9O19442 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H2-M9O19442 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M9O19442 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms