Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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