Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn2O08529 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn2O08529 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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